تجزیه و تحلیل ژنتیکی و فیلوژنتیکی ناحیه hvr۱ ژنوم میتوکندری در شش نژاد گوسفند ایرانی

Authors

زهرا سجادی زرجانی

دانشگاه یاسوج محمد رضا بحرینی بهزادی

استادیار رشته علوم دامی دانشگاه یاسوج مجید فردایی

دانشیار گروه ژنتیک پزشکی دانشگاه شیراز

abstract

سابقه و هدف: به دلیل تعداد افراد کم در جمعیت های گوسفند بومی موجود در نقاط مختلف ایران، حفظ تنوع ژنتیکی این جمعیت ها برای انجام برنامه های اصلاح نژادی بسیار مهم است. همچنین این نکته را باید متذکر شد که نژادهای گوسفند بومی به عنوان سرمایه ملی کشور محسوب می شوند و حفظ تنوع ژنتیکی آن ها بسیار ضروری می باشد. بررسی ژنوم میتوکندری شاخصی مناسب برای نشان دادن میزان تنوع ژنتیکی در جمعیت های مختلف دامی است. در پژوهش حاضر به منظور بررسی ساختار ژنتیکی و ترسیم روابط فیلوژنتیکی، ناحیه hvr1 ژنوم میتوکندری شش جمعیت از گوسفندان بومی ایران با دیگر گوسفندان خارجی موجود در بانک جهانی ژن ncbi مقایسه گردید. مواد و روش ها: از تعداد 30 رأس گوسفند متعلق به نقاط مختلف کشور شامل نژادهای قزل، مهربان، لک قشقایی، بهمئی، قره گل و کرمانی نمونه های خون جمع آوری شد. dna کلیه نمونه ها به روش شستشوی نمکی استخراج شد و به عنوان الگو جهت تکثیر و توالی-یابی ناحیه hvr1 ژنوم میتوکندری مورد استفاده قرار گرفت. سپس کمیت و کیفیت dna استخراج شده با استفاده از روش اسپکتروفوتومتری و الکتروفورز ژل آگارز 2 درصد تعیین شد. آغازگرهای رفت و برگشت جهت تکثیر بخشی از ناحیه d-loop ژنوم میتوکندری به طول 623 جفت باز طراحی گردید. واکنش زنجیره ای پلی مراز با استفاده از یک جفت آغازگر اختصاصی انجام گرفت. محصولات واکنش زنجیره ای پلی مراز پس از خالص سازی تعیین توالی شدند. این توالی ها با 19 توالی مشابه ژنوم میتوکندری دیگر متعلق به نژادهای گوسفندان موجود در بانک جهانی ژن مقایسه شده و درخت فیلوژنتیکی آن ها ترسیم گردید. یافته ها: با بررسی ناحیه hvr1 ژنوم میتوکندری گوسفندان مورد مطالعه، 39 جایگاه نوکلئوتیدی متغیر و 17 هاپلوتیپ شناسایی شد. نتایج تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که تنها 7 درصد از تغییرات در بین گروه ها و 93 درصد در درون جمعیت ها توزیع شده است. همچنین اختلاف ژنتیکی بین جمعیت های مورد مطالعه براساس شاخص تثبیت در سطح 5 درصد معنی دار نبوده و مقدار آن 071/0 محاسبه شد. نتیجه گیری: مقدار شاخص تثبیت به دست آمده در این مطالعه بیانگر این است که میزان تمایز ژنتیکی متوسط متمایل به پایین بین جمعیت های مورد مطالعه وجود داشت. نتایج فیلوژنی نشان داد که تمامی گوسفندان مورد مطالعه به جز نژاد مهربان همگی در یک کلاستر دسته بندی شدند. گروه بندی نژادهای قره گل، کرمانی، لک قشقایی، قزل و بهمئی با نژاد های مربوط به کشور های چین، ترکیه، اندونزی، تاجیکستان، هند و قزاقستان می تواند به دلیل مشابهت ژنتیکی آن ها با توجه به نزدیکی جغرافیایی مکان زیستی آن ها باشد. همچنین گوسفند نژاد مهربان با یکی از نژاد های گوسفندان چینی (شماره دسترسی dq903266.1) با هم گروه بندی شدند که در شاخه ای دیگر اما نزدیک به گوسفندان دیگر مورد مطالعه قرار گرفتند که این گروه بندی می تواند نشان دهنده قرابت ژنتیکی این دو نژاد باشد.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

تجزیه و تحلیل ژنتیکی و فیلوژنتیکی ناحیه HVR1 ژنوم میتوکندری در شش نژاد گوسفند ایرانی

سابقه و هدف: به دلیل تعداد افراد کم در جمعیت‌های گوسفند بومی موجود در نقاط مختلف ایران، حفظ تنوع ژنتیکی این جمعیت‌ها برای انجام برنامه‌های اصلاح نژادی بسیار مهم است. همچنین این نکته را باید متذکر شد که نژادهای گوسفند بومی به عنوان سرمایه ملی کشور محسوب می‌شوند و حفظ تنوع ژنتیکی آن‌ها بسیار ضروری می‌باشد. بررسی ژنوم میتوکندری شاخصی مناسب برای نشان دادن میزان تنوع ژنتیکی در جمعیت‌های مختلف دامی ا...

full text

تجزیه و تحلیل ژنتیکی و فیلوژنتیکی ناحیه hvr-i از ژنوم میتوکندری در گوسفند نژاد افشاری

خلوص ژنتیکی نژادهای گوسفند به علت تلاقی های کنترل نشده دستخوش تغییر شده است، استفاده از نشانگرهای ژنتیکی توالی­یابی ژنوم میتوکندری، یکی از راه های بررسی این تغییرات است. هدف از این تحقیق بررسی میزان تنوع  ناحیه hvr-i از ژنوم میتوکندری گوسفند نژاد افشاری می­باشد. برای این منظور از تعداد 20 رأس گوسفندان افشاری غیرخویشاوند نمونه خون جمع آوری و پس از استخراج dna از آنها، ناحیه موردنظر توسط پرایمرها...

full text

تجزیه و تحلیل ژنتیکی و فیلوژنتیکی ناحیه D-Loop ژنوم میتوکندریایی در بوقلمون بومی خراسان

هدف از این مطالعه، تجزیه ژنتیکی و فیلوژنتیک ناحیه D-LOOP ژنوم میتوکندری بوقلمون بومی خراسان بود. بدین منظور، از 20 قطعه بوقلمون بومی خراسان نمونه خون جمع آوری گردید. پس از استخراج  DNA، تکثیر قطعه 850 جفت بازی ناحیه سیتوکروم b میتوکندری توسط آغازگرهای اختصاصی انجام گرفت. قطعات تکثیر شده پس از خالص سازی به صورت رفت و برگشت توالی یابی شدند. تعداد 10 هاپلوتیپ مختلف بر اساس 5 نوکلئوتید چند شکل موجو...

full text

تجزیه و تحلیل ژنتیکی و فیلوژنتیکی ناحیه d-loop ژنوم میتوکندریایی در بوقلمون بومی خراسان

هدف از این مطالعه، تجزیه ژنتیکی و فیلوژنتیک ناحیه d-loop ژنوم میتوکندری بوقلمون بومی خراسان بود. بدین منظور، از 20 قطعه بوقلمون بومی خراسان نمونه خون جمع آوری گردید. پس از استخراج  dna، تکثیر قطعه 850 جفت بازی ناحیه سیتوکروم b میتوکندری توسط آغازگرهای اختصاصی انجام گرفت. قطعات تکثیر شده پس از خالص سازی به صورت رفت و برگشت توالی یابی شدند. تعداد 10 هاپلوتیپ مختلف بر اساس 5 نوکلئوتید چند شکل موجو...

full text

تجزیه و تحلیل ژنتیکی و فیلوژنتیکی ناحیه D-loop در شترهای تک کوهان و دوکوهان ایران

چکیده:نژادهای بومی ایران بخشی از سرمایه ملی تلقی شده بنابراین شناسایی و حفظ آن‌ها اهمیت ویژه‌ای دارد. توجه بیشتر به این نژادها از دیدگاه ژنتیک حفاظتی با توجه به کاهش شدید جمعیت آن‌ها، در برخی مناطق از اهمیت زیادی برخوردار است. شتر از جمله دام‌های اهلی مناطق بیابانی است که می‌تواند چندین روز متوالی را بدون خوردن آب سپری کند و حداکثر استفاده را از مراتع بنماید، در صورتی که این امر برای سایر دام‌ه...

full text

تجزیه و تحلیل مولکولی جمعیتی از مرغ لاری با استفاده از توالی ناحیه HVR-I ژنوم میتوکندری

مرغ‌های بومی ایرانی مواد ژنتیکی پایه برای برنامه های اصلاح نژاد محسوب میشوند. انجام برنامه‌های اصلاح نژادی در گام نخست نیازمند شناسایی و حفظ تنوع ژنتیکی این جمعیت هاست. بررسی ژنوم میتوکندری در یک نژاد و مقایسه آن با سایر نژادها میتواند شاخص مناسبی از میزان تنوع موجود در جمعیت مورد بررسی را ارائه دهد. در مطالعه حاضر، به منظور ارزیابی تنوع ژنتیکی مرغان لاری ایران، تعداد 23 قطعه مرغ از منطقه لارست...

full text

My Resources

Save resource for easier access later


Journal title:
پژوهش در نشخوارکنندگان

جلد ۴، شماره ۳، صفحات ۱۷-۳۴

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023